Senpai Wa Otokonoko Hanaoka Makoto, một nam sinh trung học có phong cách ăn mặc như con gái. Aoi Saki là hậu bối học cùng trường, đem lòng yêu Makoto và luôn tưởng rằng Makoto là con gái. Chỉ sau khi Aoi tỏ tình với Makoto và bị từ chối, sự thật mới vỡ lẽ, nhưng cô không bận tâm về giới tính của Makoto và vẫn muốn trở thành mối tình đầu của anh. Taiga Ryuji là bạn thời thơ ấu của Makoto, ban đầu tránh né việc có tình cảm với con trai. Cho nên khi cậu bắt đầu nảy sinh tình cảm với Makoto cũng chính là lúc mối tình giữa ba người bắt đầu thành hình.